2001年初，随着科技园依托学校建设的8个专业孵化器和方兴科技孵化器正式成立。北科大科技园已拥有了一定的规模和实力，具备了大学科技园的基本条件。
2003年，学校以体制创新、机制创新推动大学科技园建设，科技园公司正式成立，使大学科技园走上了现代企业发展道路。一系列相关政策的制定，激励了学校师生的创业热情，产业调整，拓展科技园的发展空间，一大批科研成果得到孵化及产业化，各类人才培养工作全面展开。同年，北科大留学人员创业园正式挂牌。
2004年，北科大科技园承担了“北京市留创企业新材料共性技术支撑体系”项目建设，与北京新材料发展中心等8家单位共同发起成立了“北京材料分析测试服务联盟”。
2005年，我校科技园又承担了“北京市新材料技术转移中心”项目建设，建立了“北京科技大学学生创业中心”，所有这些预示着北科大科技园独具特色的专业服务体系已经形成。2005年底，北京科大科技园顺利通过科技部和教育部联合专家组的验收，成为国家级大学科技园。
目前，北科大科技园已经形成了一园多区的发展格局。校内外园区占地面积共344亩，建筑总面积112000平方米，孵化总面积70200平方米。